Kurikulum yang diterapkan di MAN Kota
Palangka Raya adalah Kurikulum Merdeka untuk kelas X dan XI dan Kurikulum Tiga Belas untuk kelas XII dengan mengembangkan empat ketrampilan : 1). Tinkom
(Soft Ware, Hard Ware, Jaringan dan perawatan) (1). Elektronika
(2) Tata busana dan (3) Peternakan dan Muatan Lokal Teknologi Informasi
Komunikasi (Tinkom). Mulai tahun pelajaran 2017/2018 MAN Kota Palangka Raya mulai
menerapkan Kurikulum 2013 dengan mengembangkan empat peminatan yaitu (1). Peminatan matematika dan ilmu alam (2).
Peminatan ilmu-ilmu sosial (3). Peminatan ilmu bahasa dan budaya dan (4).
Peminatan ilmu agama dengan tujuan memberi kesempatan kepada peserta didik
mengembangkan kecerdasan sesuai bakat dan
minatnya terhadap suatu disiplin ilmu dan ketrampilan tertentu. Terakhir, sejak tahun 2021, MAN Kota Palangka Raya merupakan salah satu sekolah piloting Kurikulum Merdeka di Kalimantan Tengah.